1. 标本间穿插污染:标本污染首要有搜集标本的容器被污染，或标本放置时，因为 密封不严溢于容器外，或容器外粘有标本而构成相互间穿插污染;标本核酸模板在提 取过程中，因为吸样枪污染导致标本间污染;有些微生物标本尤其是病毒可随气溶胶或构成气溶胶而分散，导致彼此间的污染。
2. PCR试剂的污染:首要是因为在PCR试剂制造过程中，因为加样枪、容器、双蒸水 及其它溶液被PCR核酸模板污染。
3. PCR扩增产品污染.这是PCR反响中最首要最-常见的污染问题.因为PCR产品复制量 大(一般为1013复制/ml)，远高于PCR检测数个复制的极限，所以极微量的PCR产品 污染，就可构成假阳就可构成假阳性。
还有一种简单忽视，最会构成PCR产品污染的方式是气溶胶污染;在空气与液面子摩 擦时就可构成气溶胶，在操作时比较剧烈地摇摆反响管，开盖时、吸样时及污染进样 枪的重复吸样都可构成气溶胶而污染.据核算一个气溶胶颗粒可含48 000复制，因此由 其构成的污染是一个值得很注重的问题。
4. 试验室中克隆质粒的污染:在分子生物学试验室及某些用克隆质粒做阳性对照的查验室，这样的一个问题也很常见.因为克隆质粒在单位容积内含量恰当高，别的在纯化过程中需用较多的用具及试剂，并且在活细胞内的质粒，因为活细胞的成长繁衍的简便性及具有很强的生命力.其污染或许性也很大。
一个好的试验室，要时间留意污染的监测，考虑有无污染是什么问题导致的污染，以便采纳必定的办法，防止和消除污染。
1. 阳性对照：在树立PCR反响试验室及一般的查验单位都应设有PCR阳性对照，它是PCR 反响是否成功、产品条带方位及巨细是否符合理论要求的一个重要的参阅标志.阳性 对照要挑选扩增度中等、重复性好，经各种判定是该产品的标本，如以重组质粒为阳 性对照，其含量宜低不宜高(100个复制以下)。但阳性对照尤其是重组质粒及高浓度阳 性标本，其对检测或扩增样品污染的或许性很大.因此当某一PCR试剂经自己运用稳 定，查验人员心中有数时，在今后的试验中可免设阳性对照。
2. 阴性对照：每次PCR试验必须做阴性对照.它包含①标本对照:被检的标本是血清就用 判定后的正常血清作对照;被检的标本是组织细胞就用相应的组织细胞作对照。②试剂 对照:在PCR试剂中不加模板DNA或RNA，进行PCR扩增，以监测试剂是否污染。
1. 合理分隔试验室:将样品的处理、制造PCR反响液、PCR循环扩增及PCR产品的判定等过程分区或分室进行，分外的留意样本处理及PCR产品的判定应与其它过程严厉分隔。最-好能区分：①标本处理区；②PCR反响液制备区；③PCR循环扩增区;④PCR产品判定区。其试验用品及吸样枪应专用。试验前应将试验室用紫外线消毒以损坏残留的DNA或RNA。
2. 吸样枪:吸样枪污染是一个有必要留意一下的问题.因为操作时不当心将样品或模板核酸吸 入枪内或粘上枪头是一个严峻的污染源，因此加样或汲取模板核酸时要非常当心，吸 样要慢，吸样时尽量一次性完结，忌屡次抽吸，防止穿插污染或发生气溶胶污染。
3. 预混和分装PCR试剂:一切的PCR试剂都应小量分装，如有或许，PCR反响液应预先 制造好，然后小量分装，-20℃保存。以削减重复加样次数，防止污染时机.别的，PCR试剂，PCR反响液应与样品及PCR产品分隔保存，不该放于同一冰盒或同一 冰箱。
5. 建立恰当的阳性对照和阴性对照，阳性对照以能呈现扩增条带的最低量的规范病 原体核酸为宜，并留意穿插污染的或许性，每次反响都应有一管不加模板的试剂对照 及相应不含有被扩增核酸的样品作阴性对照。
7. 挑选质量好的Eppendorf管，以防止样本外溢及外来核酸的进入，翻开离心管前 应先离心，将管壁及管盖上的液体甩至管底部。开管动作要轻，以防管内液体溅起